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 生物信息学服务
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亚型分析及亚型特异基因发掘 |
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| 对于定制芯片，由于基因数目相对于基因组芯片来说较少，所以可以在芯片原始数据z-score归一化后，取所有基因作芯片方向的聚类分析。对于基因总数<2000的芯片，层次聚类等聚类算法可以有效地进行。 这样可以直接将多张芯片归入不同的组，即亚型。该实例的32张芯片中，28张芯片为糖尿病II型的，4张为糖尿病I型的。 |
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| 计算每个基因的信息熵，信息熵越大表明分子在各张芯片中的表达是一致的。而低信息熵基因则可能是亚型特异的（只在某种亚型中特异表达）。结合基因筛选算法，我们可以将这种基因查找出来作为该种亚型的签名基因。我们找到3个II型糖尿病特异基因。 |
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